O tratamento clínico da diarreia depende da causa, mas, em geral, envolve a reposição de líquidos e eletrólitos para evitar a desidratação. A hidratação pode ser feita com soro caseiro, soluções de reidratação oral ou aumento do consumo de água, chás e caldos leves. A alimentação deve ser leve e de fácil digestão, evitando alimentos gordurosos, ricos em fibras insolúveis e derivados de leite, que podem piorar o quadro.
Probióticos podem ser indicados para ajudar na recuperação da flora intestinal.

Em alguns casos, quando há infecção bacteriana, o uso de antibióticos pode ser necessário, mas sempre sob orientação médica.
Se a diarreia persistir por mais de dois dias, estiver acompanhada de febre alta ou sinais de desidratação, é essencial procurar um profissional de saúde.